隐秘的交换描绘了《奥特银河之战 命运的冲突》后的插曲。　　在与阿布索留特一族的激战之后，银河救援队在行星Maijii上察觉到了异常现象。但是由于利布特奥特曼不在身边，不得不单身调查的索拉，陷入了危机...　　听闻紧急消息的雷格罗斯奥特曼，肩负身上宇宙幻兽拳的使命，前往救出索拉的任务！